Os serviços de scanner de contentores são oferecidos para ajudar na protecção contra os riscos de segurança envolvidos no comércio internacional e para melhorar as tarefas aduaneiras tradicionais. A Cotecna utiliza uma tecnologia não invasiva de scanning de carregamentos para verificar o conteúdo de contentores, melhorando assim a eficiência de custos para a alfândega. Os scanners apresentam a vantagem de serem capazes de analisar o conteúdo de envios de forma rápida e exacta, sem que seja necessário abrir os contentores. Podem ser utilizados scanners de raios X convencionais para detectar objectos, com base na respectiva densidade e forma, mas não na composição. No entanto, a tecnologia utilizada pela Cotecna é a de um scanner de neutrões, que é única na utilização de raios gama e análise de neutrões para a elaboração de uma imagem e ajuda a identificar a composição do objecto submetido ao scanner.
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